Le coût total d'un chauffe-eau solaire installé par un professionnel démarre à moins de 5,000 euros, hors subventions. Dans le cas où une surface de capteurs importante est nécessaire et que le lien avec l'appoint doit être optimal, le coût peut dépasser les 7,000 euros.
Compte tenu de la valeur des composants, les prix paraissent trop élevés. Fonctionnant en thermosiphon et conçus pour être posés sur un toit terrasse, un chauffe-eau solaire coûte moins de 1,000 euros en Grèce. Les fournitures constituent environ de 70 % à 80 % du coût total d'un chauffe-eau solaire, l'installation étant plus chère avec capteurs intégrés qu'avec capteurs posés. Un chauffe-eau solaire avec capteurs intégrés est environ 10 % plus cher qu'avec des capteurs posés en toiture.
Les crédits d'impôt réalisent une pression à la hausse sur le prix des équipements et bénéficient en pratique davantage aux ménages aisés. Les installateurs ont tendance à surévaluer le coût des fournitures et sous-évaluer celui de la pose, compte tenu du fait que les crédits d'impôts ne sont disponibles que pour les fournitures.
Des chauffe-eau solaire à circulation forcée peuvent être trouvés à moins de 2,500 euros dans certaines grandes surfaces. Ceux-ci ne possèdent pas la certification CSTBât, mais leur qualité n'est pas nécessairement inférieure. La plupart des équipements sont importés d'Allemagne ou d'Autriche, ainsi que d'Europe de l'Est, de Turquie et la Chine.